小樽市総合博物館（おたるしそうごうはくぶつかん）は、北海道小樽市手宮1丁目にある北海道の歴史や自然、鉄道をはじめとした交通、科学などに関する展示を行う博物館である。 2007年（平成19年）7月14日、小樽市博物館（おたるしはくぶつかん）と小樽市青少年科学技術館（2006年12月閉館）の機能を統合し、手宮駅にあった第三セクター運営の小樽交通記念館（おたるこうつうきねんかん。2006年3月閉館）の施設を活用する形で発足したもので、旧小樽交通記念館の施設に事務機能を集約し、本館とした。なお、旧・小樽市博物館は運河館と改称された。